Το Πανεπιστήμιο Πειραιώς διαθέτει τις παρακάτω Σχολές, στις οποίες εντάσσονται τα Ακαδημαϊκά Τμήματα:

Σχολή Οικονομικών, Επιχειρηματικών και Διεθνών Σπουδών

Σχολή Ναυτιλίας και Βιομηχανίας

Σχολή Χρηματοοικονομικής και Στατιστικής

Σχολή Τεχνολογιών Πληροφορικής και Επικοινωνιών